單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)被Nature Methods(2013)評(píng)為年度技術(shù),Science(2013)評(píng)為年度六大生物類科研熱點(diǎn)。單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)又在2015年登上Science轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)封面。Nature Methods 將2019年年度技術(shù)又給了單細(xì)胞多組學(xué)。2013年以來基于單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)獲得了多方面的研究進(jìn)展,文獻(xiàn)發(fā)表也呈現(xiàn)迅猛增長(zhǎng)趨勢(shì)。即使來源相同的單個(gè)細(xì)胞,由于隨機(jī)生物過程和環(huán)境擾動(dòng)的原因,彼此在許多
方面也存在差異,即異質(zhì)性。尤其是腫瘤細(xì)胞、免疫細(xì)胞、胚胎發(fā)育期細(xì)胞、干細(xì)胞等最為突出。常規(guī)的組學(xué)技術(shù)發(fā)現(xiàn)不了這一現(xiàn)象帶來的影響,由此研究人員開啟了單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的探索之路。
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序利用GemCode技術(shù)的微流控技術(shù)進(jìn)行單個(gè)細(xì)胞分選,將帶有條形碼和引物的凝膠珠和單個(gè)細(xì)胞包裹在油滴中;在每個(gè)油滴內(nèi),凝膠珠溶解,細(xì)胞裂解釋放mRNA,通過逆轉(zhuǎn)錄把凝膠珠
的特異性barcode引入到cDNA并用于區(qū)分細(xì)胞;液體油層破壞后,cDNA后續(xù)進(jìn)行文庫構(gòu)建,結(jié)合Illumina測(cè)序平臺(tái)對(duì)文庫進(jìn)行測(cè)序檢測(cè),即可一次性獲得大量單細(xì)胞的基因表達(dá)數(shù)據(jù),從而達(dá)到在單細(xì)胞
水平進(jìn)行表達(dá)測(cè)序的目的。10x Genomics 的 Chromium Single Cell單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,極大地促進(jìn)了單細(xì)胞組學(xué)研究。
特點(diǎn):
l 真正意義上的單細(xì)胞檢測(cè)(每一個(gè)細(xì)胞形成單獨(dú)的GEM,分別進(jìn)行細(xì)胞標(biāo)記)
l 超低的單個(gè)細(xì)胞價(jià)格
l 多細(xì)胞捕獲率低(小于萬分之八)
l 超高的捕獲效率(單個(gè)細(xì)胞捕獲效率65%)
l 全自動(dòng)真正單細(xì)胞分離、實(shí)驗(yàn)周期短
l 超高的細(xì)胞通量(每個(gè)樣本最多可測(cè)10000個(gè)細(xì)胞)
l 細(xì)胞類型多樣化(適宜40微米直徑以內(nèi),無下限)
通量高(可同時(shí)檢測(cè)8個(gè)樣本)
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